مستند مسجد جمکران قضيه اي است که مرحوم حاجي نوري در کتاب «نجم الثاقب» و «جنّة المأوي» و «الکلمة الطيّبة» و نيز ميرزا محمّد تقي ارباب قمي در کتاب «تاريخ دارالايمان» و ديگران از کتاب «تاريخ قم» تأليف حسن بن محمد بن حسن قمي، به نقل از کتاب «مونس الحزين» محمّد بن بابويه معروف به شيخ صدوق نقل کرده اند.

اين نقل مشتمل بر قضيّه اي از حسن بن مثله جمکراني رحمه الله است که در آن اشاره به ملاقاتي شده که او در سال 293 هجري در بيداري با امام زمان عليه السلام داشته است. در اين ديدار حضرت به او دستور مي دهد که با عالم جليل القدر سيد ابي الحسن الرضا از علماي قم ارتباط پيدا کرده و با کمک او مسجدي را در اين مکان موجود بنا نمايد... [1] .

قابل توجه اينکه کتاب «انوار المشعشعين» از کتاب «تاريخ قم» و او نيز از کتاب «مونس الحزين» از اميرالمؤمنين عليه السلام، قضيه به اهتزاز در آمدن پرچم امام زمان عليه السلام از مسجد جمکران را نقل کرده است.